近年来一些大楼也已意识到中央空调水处理的重要性，并采取了水处理措施。这些措施大多参照工业循环冷却水处理的方法，但中央空调冷媒水、热媒水系统的管、道像蜘蛛网一样布满整幢大楼，其管路的复杂程度远非一般的循环冷却水可比，存在很多的滞流区域和死角，一个合理的水处理措施应该考虑到整个系统的各个方面。
冷却水系统工作过程中，水中的钙镁离子和碳酸根离子受热后互相结合，形成盐（碳酸钙、镁）沉淀附着在热交换面及填料表面上，尤其是沉淀在主机冷凝器铜管上结成水垢，由于水垢的导热系数为1.1，而铜管的导热系数为170左右，二者差异悬殊，水垢的形成阻碍制冷液的热量散出，大大降低了热交换效率， 进而降低了机组制冷效率，据测算，当冷却水系统结垢0.8㎜左右时，主机制冷效率降低40%，其直接后果是浪费能源、影响使用，我们常见到的机组高压升 高、温度上升，甚至自动保护停机，其原因之一就是结垢所致，此外，水垢易导致垢下腐蚀，进而引起蚀漏，危害设备，因此需对冷却水进行水处理，使水质符 合机组运行要求。
此外，水中的氧腐蚀问题也很严重，我们常见的锈水（红水）、铁锈渣都是氧腐蚀产物，这些管道内壁脱落的铁锈渣，随水运行会堵塞过滤网造成机组冷却 水流不畅，冷却不足，进而影起机组高压，跳闸保护。同时，滤网堵塞还会造成过滤网损坏，铁锈及垢渣进入机组冷凝器，进而堵塞冷凝器铜管，使机组出力减小， 能耗增加，制冷效率下降。而水处理是根据机组制冷功率及循环水量、水质等多项指标，定期、定量往循环冷却水中加入防腐阻垢剂及灭藻剂，使系统内不产生 水垢、不产生氧腐蚀、无锈渣脱落、无生物藻类及藻泥。
综上所述，水处理能满足机组运行对水质要求，防止制冷效率降低，节约能源，延长设备的使用寿命等诸多优点，且经济效益明显。
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