在采挖前期，积温相对较低，冬虫夏草子座的生长速度相对较慢，在采挖出土时，大部分虫草的子座相对较短较细，虫身普遍比较饱满，表面颜色较靓；进入中期，积温已明显升高，冬虫夏草子座的生长速度显著变快，在采挖出土时，多数虫草的子座会长得较粗较长，虫身饱满度和颜色也明显下降；而进入采挖后期，积温已大幅升高，冬虫夏草子座的生长速度已大大加快，在采挖出土时，绝大部分虫草的子座已长得又粗又长，子座生长消耗了虫身太多的营养，导致虫身饱满度和颜色都变差了。
不同产地形成的冬虫夏草，寄主幼虫会有一定的差异，寄主幼虫的差异是形成冬虫夏草的气味不同的关键因素；虽然寄主幼虫都是鳞翅目蝙蝠蛾科蝠蛾属，但在蝠蛾属下面还分多种蝠蛾，不同种的蝠蛾幼虫有一定差异，导致最终形成的冬虫夏草的气味出现不同
每年盛夏来临之时，在海拔3000米以上的青藏高原冬虫夏草产区，有一种昆虫名叫虫草蝙蝠蛾进入产卵期，体小身花的雌性成年蝙蝠蛾便将千千万万个虫卵产在地面的植被上，经一个月左右时间的孵化后，蛾卵变成小虫再钻进潮湿疏松的土壤里，靠吸食植物根茎的营养而生长，逐渐将身体养得洁白肥胖。土层里有一种球形的虫草真菌子囊孢子，当虫草蝙幅蛾幼虫受到孢子侵袭后身体开始出现病变便钻到地面浅层，而虫草真菌孢子在幼虫体内继续生长，幼虫的内脏就一点点被侵蚀直至消失，最后头朝上尾朝下而死去，这时幼虫身体变成了一个充满菌丝的躯壳，埋藏在土层里，这就是“冬虫”。经过一个冬天，到第二年春夏季，随着气温渐渐升高，虫体内的菌丝又开始生长，最后从死去幼虫的口或头部长出一根紫红色的小草钻出地面，草通常长约二至五厘米，顶端有菠萝状的囊壳，这就是“夏草”。这样，虫草蝙蝠蛾幼虫的躯壳与长出来的小草共同组成了一个完整的“冬虫夏草”。
冬虫夏草保存的要点是：低温干燥，低温、干燥的储存环境，能大大延缓冬虫夏草所含成分的氧化与降解速度，最有利于保护冬虫夏草的外观品相与内在药用价值。